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尊龙凯时非接触式超声波DNA打断仪不同型号实验效果对比分析

发布时间:2025-02-22   信息来源:桑宇凤

尊龙凯时的实验目的是对全基因组DNA样品进行200-500bp区间的均一性片段化处理。为此,本次实验选用了三款非接触打断仪器,分别为小美超声-高通量声波基因组剪切仪、bioruptor-非接触式超声破碎仪以及小美超声-聚能式超声波DNA打断仪。实验所需材料为核酸浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液。

尊龙凯时非接触式超声波DNA打断仪不同型号实验效果对比分析

实验步骤如下:

  1. 提前15分钟启动三款仪器的冷水机,设置温度为4℃。
  2. 将100μL浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液加入到每个爱思进品牌的15mLEP管中。
  3. 将装好样品的15mLEP管分别放入三款仪器的适配器中,其他空余孔位用相同体积的水填充。
  4. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长分别为15分钟和20分钟,以进行两个梯度对比。
  5. 程序结束后,取出样品使用毛细管电泳检测基因组片段化情况。

实验结果如下:

  1. 小美超声-高通量声波基因组剪切仪
    1. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长15分钟,平均片段大小:3100bp
    2. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长20分钟,平均片段大小:3001bp
  2. bioruptor-非接触式超声破碎仪
    1. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长15分钟,平均片段大小:4329bp
    2. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长20分钟,平均片段大小:4058bp
  3. 小美超声-聚能式超声波DNA打断仪
    1. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长15分钟,平均片段大小:3655bp
    2. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长20分钟,平均片段大小:3881bp

三款仪器的实验结果汇总显示,当基因组片段在200-500bp区间的占比越高且峰图越平缓时,表明基因组片段的均一性更佳。具体而言,在样品和程序设定等条件相同的情况下,bioruptor的非接触式超声破碎仪和小美超声的聚能式超声波DNA打断仪在200-500bp区间的占比分别为58.3%和65.4%,且峰图呈现陡坡状,说明均一性较差。而小美超声的高通量声波基因组剪切仪在同一区间的占比达到64.7%,峰图平缓,进一步验证了其出色的均一性表现。

综上所述,利用尊龙凯时的设备进行全基因组DNA片段化处理,不仅可以得到更均一的片段,还能为后续的生物医药研究提供高质量的样本。